2025/03/27 更新

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アベ マサト
安部 真人
Abe Masato
所属
大学院農学研究科 生命機能学専攻 准教授
職名
准教授
連絡先
メールアドレス
プロフィール
脂質の化学合成を行っています。特にリン脂質の合成を得意としており、近年は糖脂質やスフィンゴ脂質の合成にも着手しています。脂質の生理機能、特に生体膜における膜タンパク質との関わりに焦点を当てた構造活性相関研究を進めています。天然脂質が持つ、いまだ明らかにされていない機能を知ることを目的としています。また、有用な合成脂質を産み出すことも狙いの一つです。
外部リンク

学位

  • 博士(農学) ( 京都大学大学院農学研究科 )

研究キーワード

  • シトクロムc

  • ペルオキシダーゼ

  • アポトーシス

  • ミトコンドリア

  • リポソーム

  • 有機合成

  • カルジオリピン

  • ホスファチジルコリン

  • 脂質

  • 生体膜

研究分野

  • ライフサイエンス / 生物有機化学

学歴

  • 京都大学   大学院農学研究科   応用生命科学専攻 博士後期課程修了

    2004年4月 - 2007年3月

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  • 京都大学   大学院農学研究科   応用生命科学専攻 修士課程修了

    2002年4月 - 2004年3月

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  • 京都大学   農学部   生物機能科学科 卒業

    1998年4月 - 2002年3月

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経歴

  • 愛媛大学   大学院農学研究科   准教授

    2018年4月 - 現在

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  • 京都大学   大学院農学研究科   助教

    2009年9月 - 2018年3月

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  • 九州大学   先導物質化学研究所   学術研究員

    2009年4月 - 2009年8月

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  • 九州大学   先導物質化学研究所   機関研究員

    2008年4月 - 2009年3月

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  • 京都大学   大学院農学研究科   21世紀COE研究員

    2007年4月 - 2008年3月

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  • 京都大学   大学院農学研究科   学振特別研究員(DC2)

    2006年4月 - 2007年3月

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所属学協会

委員歴

  • 日本農薬学会 農薬デザイン研究会   関西委員  

    2018年4月 - 2019年3月   

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    団体区分:学協会

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  • 日本農薬学会編集事務局   編集幹事  

    2017年4月 - 2019年3月   

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    団体区分:学協会

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  • 日本農芸化学会 若手シンポジウム   実行委員  

    2016年9月 - 2017年3月   

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    団体区分:学協会

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  • 日本農芸化学会関西支部   会計幹事  

    2015年5月 - 2017年5月   

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    団体区分:学協会

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  • 日本農芸化学会 若手シンポジウム   実行委員  

    2011年9月 - 2012年3月   

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    団体区分:学協会

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論文

  • Identification of a novel enzyme from E. pacifica that acts as an eicosapentaenoic 8R-LOX and docosahexaenoic 10R-LOX. 国際誌

    Sayaka Yuki, Aiko Uemura, Mayuka Hakozaki, Akira Yano, Masato Abe, Yoshihisa Misawa, Naomichi Baba, Hidetoshi Yamada

    Scientific reports   10 ( 1 )   20592 - 20592   2020年11月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    North Pacific krill (Euphausia pacifica) contain 8R-hydroxy-eicosapentaenoic acid (8R-HEPE), 8R-hydroxy-eicosatetraenoic acid (8R-HETE) and 10R-hydroxy-docosahexaenoic acid (10R-HDHA). These findings indicate that E. pacifica must possess an R type lipoxygenase, although no such enzyme has been identified in krill. We analyzed E. pacifica cDNA sequence using next generation sequencing and identified two lipoxygenase genes (PK-LOX1 and 2). PK-LOX1 and PK-LOX2 encode proteins of 691 and 686 amino acids, respectively. Recombinant PK-LOX1 was generated in Sf9 cells using a baculovirus expression system. PK-LOX1 metabolizes eicosapentaenoic acid (EPA) to 8R-HEPE, arachidonic acid (ARA) to 8R-HETE and docosahexaenoic acid (DHA) to 10R-HDHA. Moreover, PK-LOX1 had higher activity for EPA than ARA and DHA. In addition, PK-LOX1 also metabolizes 17S-HDHA to 10R,17S-dihydroxy-docosahexaenoic acid (10R,17S-DiHDHA). PK-LOX1 is a novel lipoxygenase that acts as an 8R-lipoxygenase for EPA and 10R-lipoxygenase for DHA and 17S-HDHA. Our findings show PK-LOX1 facilitates the enzymatic production of hydroxy fatty acids, which are of value to the healthcare sector.

    DOI: 10.1038/s41598-020-77386-3

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  • Isolation of isolactarane sesquiterpenes from a Phlebia tremellosa culture filtrate and their growth promotion effects on lettuce roots.

    Atsushi Ishihara, Chisaki Ashida, Naoki Ube, Masato Abe, Hidetaka Hiyoshi, Kazuto Umezu, Naoki Endo, Kozue Sotome, Nitaro Maekawa, Akira Nakagiri, Kumiko Osaki-Oka, Tsuyoshi Ichiyanagi, Kotomi Ueno

    Journal of pesticide science   44 ( 1 )   9 - 14   2019年2月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    The ethyl acetate extract of the culture filtrate of Phlebia tremellosa promoted elongation of the lateral roots of lettuce seedlings at 250 µg/mL. We purified two compounds that promote root elongation by using activity-guided chromatographic fractionation. On the basis of spectroscopic analyses, these compounds were identified to be isolactarane sesquiterpenes derived from the dehydrogenation of merulactone, which was previously isolated from the same species. We named the purified compounds phlelactones A and B. Phlelactones A and B promoted primary root elongation at 100-300 and 10-30 µg/mL and the elongation and formation of lateral roots at 300-1000 and 30-100 µg/mL, respectively.

    DOI: 10.1584/jpestics.D18-056

    PubMed

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  • Role of Acyl Chain Composition of Phosphatidylcholine in Tafazzin-Mediated Remodeling of Cardiolipin in Liposomes 査読

    Masato Abe, Yoshiki Sawada, Shinpei Uno, Shuhei Chigasaki, Masahide Oku, Yasuyoshi Sakai, Hideto Miyoshi

    BIOCHEMISTRY   56 ( 47 )   6268 - 6280   2017年11月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:AMER CHEMICAL SOC  

    Remodeling of the acyl chain compositions of cardiolipin (CL) species by the transacylase tafazzin is an important process for maintaining optimal mitochondrial functions. The results of mechanistic studies on the tafazzin-mediated transacylation from phosphatidylcholine (PC) to monolyso-CL (MLCL) in artificial lipid membranes are controversial. The present study investigated the role of the acyl chain composition of PC in the Saccharomyces cerevisiae tafazzin-mediated remodeling of CL by examining the structural factors responsible for the superior acyl donor ability of dipalmitoleoyl (16:1) PC over dipalmitoyl (16:0) PC. To this end, we synthesized systematic derivatives of dipalmitoleoyl PC; for example, the location of the cis double bond was migrated from the Delta 9-position toward either end of the acyl chains (the Delta 5- or Delta 13-position), the cis double bond in the sn-1 or sn-2 position or both, was changed to a trans form, and palmitoleoyl and palmitoyl groups were exchanged in the sn-1 and sn-2 positions, maintaining similar PC fluidities. Analyses of the tafazzin-mediated transacylation from these PCs to sn-2'-MLCL(18:1-18:1/18:1-OH) in the liposomal membrane revealed that tafazzin strictly discriminates the molecular configuration of the acyl chains of PCs, including their glycerol positions (sn-1 or sn-2); however, the effects of PC fluidity on the reaction may not be neglected. On the basis of the findings described herein, we discuss the relevance of the so-called thermodynamic remodeling hypothesis that presumes no acyl selectivity of tafazzin.

    DOI: 10.1021/acs.biochem.7b00941

    Web of Science

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  • Mechanism for Remodeling of the Acyl Chain Composition of Cardiolipin Catalyzed by Saccharomyces cerevisiae Tafazzin 査読

    Masato Abe, Yui Hasegawa, Masahide Oku, Yoshiki Sawada, Eriko Tanaka, Yasuyoshi Sakai, Hideto Miyoshi

    JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY   291 ( 30 )   15491 - +   2016年7月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:AMER SOC BIOCHEMISTRY MOLECULAR BIOLOGY INC  

    Remodeling of the acyl chains of cardiolipin (CL) is responsible for final molecular composition of mature CL after de novo CL synthesis in mitochondria. Yeast Saccharomyces cerevisiae undergoes tafazzin-mediated CL remodeling, in which tafazzin serves as a transacylase from phospholipids to monolyso-CL (MLCL). In light of the diversity of the acyl compositions of mature CL between different organisms, the mechanism underlying tafazzin-mediated transacylation remains to be elucidated. We investigated the mechanism responsible for transacylation using purified S. cerevisiae tafazzin with liposomes composed of various sets of acyl donors and acceptors. The results revealed that tafazzin efficiently catalyzes transacylation in liposomal membranes with highly ordered lipid bilayer structure. Tafazzin elicited unique acyl chain specificity against phosphatidylcholine (PC) as follows: linoleoyl (18:2) > oleoyl (18:1) = palmitoleoyl (16:1) >> palmitoyl (16:0). In these reactions, tafazzin selectively removed the sn-2 acyl chain of PC and transferred it into the sn-1 and sn-2 positions of MLCL isomers at equivalent rates. We demonstrated for the first time that MLCL and dilyso-CL have inherent abilities to function as an acyl donor to monolyso-PC and acyl acceptor from PC, respectively. Furthermore, a Barth syndrome-associated tafazzin mutant (H77Q) was shown to completely lack the catalytic activity in our assay. It is difficult to reconcile the present results with the so-called thermodynamic remodeling hypothesis, which premises that tafazzin reacylates MLCL by unsaturated acyl chains only in disordered non-bilayer lipid domain. The acyl specificity of tafazzin may be one of the factors that determine the acyl composition of mature CLin S. cerevisiae mitochondria.

    DOI: 10.1074/jbc.M116.718510

    Web of Science

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  • Bongkrekic Acid Analogue, Lacking One of the Carboxylic Groups of its Parent Compound, Shows Moderate but pH-insensitive Inhibitory Effects on the Mitochondrial ADP/ATP Carrier 査読

    Atsushi Yamamoto, Keisuke Hasui, Hiroshi Matsuo, Katsuhiro Okuda, Masato Abe, Kenji Matsumoto, Kazuki Harada, Yuya Yoshimura, Takenori Yamamoto, Kazuto Ohkura, Mitsuru Shindo, Yasuo Shinohara

    CHEMICAL BIOLOGY & DRUG DESIGN   86 ( 5 )   1304 - 1322   2015年11月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:WILEY-BLACKWELL  

    Bongkrekic acid, isolated from Burkholderia cocovenenans, is known to specifically inhibit the mitochondrial ADP/ATP carrier. However, the manner of its interaction with the carrier remains elusive. In this study, we tested the inhibitory effects of 17 bongkrekic acid analogues, derived from the intermediates obtained during its total synthesis, on the mitochondrial ATP/ATP carrier. Rough screening of these chemicals, performed by measuring their inhibitory effects on the mitochondrial ATP synthesis, revealed that 4 of them, KH-1, KH-7, KH-16, and KH-17, had moderate inhibitory effects. Further characterization of the actions of these 4 analogues on mitochondrial function showed that KH-16 had moderate; KH-1 and KH-17, weak; and KH-7, negligible side effects of both permeabilization of the mitochondrial inner membrane and inhibition of the electron transport, indicating that only KH-7 had a specific inhibitory effect on the mitochondrial ADP/ATP carrier. Although the parental bongkrekic acid showed a strong pH dependency of its action, the inhibitory effect of KH-7 was almost insensitive to the pH of the reaction medium, indicating the importance of the 3 carboxyl groups of bongkrekic acid for its pH-dependent action. A direct inhibitory effect of KH-7 on the mitochondrial ADP/ATP carrier was also clearly demonstrated.

    DOI: 10.1111/cbdd.12594

    Web of Science

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  • Efficient Total Synthesis of Bongkrekic Acid and Apoptosis Inhibitory Activity of Its Analogues 査読

    Kenji Matsumoto, Masaki Suyama, Satoshi Fujita, Takuya Moriwaki, Yukiko Sato, Yoshifumi Aso, Satoshi Muroshita, Hiroshi Matsuo, Keishi Monda, Katsuhiro Okuda, Masato Abe, Hiroyuki Fukunaga, Arihiro Kano, Mitsuru Shindo

    CHEMISTRY-A EUROPEAN JOURNAL   21 ( 32 )   11590 - 11602   2015年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:WILEY-V C H VERLAG GMBH  

    Bongkrekic acid (BKA), isolated from the bacterium Burkholderia cocovenenans, is an inhibitor of adenine nucleotide translocator, which inhibits apoptosis, and is thus an important tool for the mechanistic investigation of apoptosis. An efficient total synthesis of BKA has been achieved by employing a three-component convergent strategy based on Kocienski-Julia olefination and Suzuki-Miyaura coupling. It is noteworthy that segmentB has been prepared as a new doubly functionalized coupling partner, which contributes to shortening of the number of steps. Torquoselective olefination with an ynolate has also been applied for the efficient construction of an unsaturated ester. Furthermore, it is revealed that 1-methyl-2-azaadamantane N-oxyl is an excellent reagent for final oxidation to afford BKA in high yield. Based on the total synthesis, several BKA analogues were prepared for structure-activity relationship studies, which indicated that the carboxylic acid moieties were essential for the apoptosis inhibitory activity of BKA. More easily available BKA analogues with potent apoptosis inhibitory activity were also developed.

    DOI: 10.1002/chem.201501304

    Web of Science

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  • Syntheses of photoreactive cardiolipins for a photoaffinity labeling study 査読

    Masato Abe, Masaaki Nakano, Ayumi Kosaka, Hideto Miyoshi

    TETRAHEDRON LETTERS   56 ( 17 )   2258 - 2261   2015年4月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:PERGAMON-ELSEVIER SCIENCE LTD  

    The photoaffinity labeling technique using photoreactive cardiolipin (CL) is a powerful means for investigating the molecular mechanism of the formation of a specific cytochrome c-cardiolipin complex. Using phosphoramidite chemistry, we synthesized three photoreactive CLs, that possess an unstable diazirine ring at different positions; that is, the acyl chain in the sn-1 or sn-2 position and the central glycerol moiety. (C) 2015 Elsevier Ltd. All rights reserved.

    DOI: 10.1016/j.tetlet.2015.03.056

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  • Design and synthesis of conformationally constrained analogues of cis-cinnamic acid and evaluation of their plant growth inhibitory activity 査読

    Keisuke Nishikawa, Hiroshi Fukuda, Masato Abe, Kazunari Nakanishi, Yuta Tazawa, Chihiro Yamaguchi, Syuntaro Hiradate, Yoshiharu Fujii, Katsuhiro Okuda, Mitsuru Shindo

    PHYTOCHEMISTRY   96   223 - 234   2013年12月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:PERGAMON-ELSEVIER SCIENCE LTD  

    1-O-cis-Cinnamoyl-beta-D-glucopyranose is known to be one of the most potent allelochemical candidates and was isolated from Spiraea thunbergii Sieb by Hiradate et al. (2004), who suggested that it derived its strong inhibitory activity from cis-cinnamic acid, which is crucial for phytotoxicity. In this study, key structural features and substituent effects of cis-cinnamic acid (cis-CA) on lettuce root growth inhibition was investigated. These structure-activity relationship studies indicated the importance of the spatial relationship of the aromatic ring and carboxylic acid moieties. In this context, conformationally constrained cis-CA analogues, in which the aromatic ring and cis-olefin were connected by a carbon bridge, were designed, synthesized, and evaluated as plant growth inhibitors. The results of the present study demonstrated that the inhibitory activities of the five-membered and six-membered bridged compounds were enhanced, up to 0.27 mu M, and were ten times higher than cis-CA, while the potency of the other compounds was reduced. (C) 2013 Elsevier Ltd. All rights reserved.

    DOI: 10.1016/j.phytochem.2013.10.001

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  • Critical role of a methyl group on the γ-lactone ring of annonaceous acetogenins in the potent inhibition of mitochondrial complex i 査読

    N. Kojima, M. Abe, Y. Suga, K. Ohtsuki, T. Tanaka, H. Iwasaki, M. Yamashita, H. Miyoshi

    Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters   23 ( 5 )   1217 - 1219   2013年3月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bmcl.2013.01.018

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  • Antimycin A-like molecules inhibit cyclic electron transport around photosystem I in ruptured chloroplasts 査読

    Yoshichika Taira, Yuki Okegawa, Kazuhiko Sugimoto, Masato Abe, Hideto Miyoshi, Toshiharu Shikanai

    FEBS OPEN BIO   3   406 - 410   2013年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:ELSEVIER SCIENCE LONDON  

    Antimycin A(3) (AA) is used as an inhibitor of cyclic electron transport around photosystem I. However, the high concentrations of AA that are needed for inhibition have secondary effects, even in chloroplasts. Here, we screened for chemicals that inhibited ferredoxin-dependent plastoquinone reduction in ruptured chloroplasts at lower concentrations than those required for AA. We identified two AA-like compounds: AAL1 and AAL2. AAL1 likely shares an inhibitory site with AA, most probably in the PGR5-PGRL1 protein complex, and enhances O-2 evolution in photosystem II, most likely via an uncoupler-like effect. AAL1 and AAL2 are unlikely to penetrate intact leaves. In ruptured chloroplasts, AALs are superior to AA as inhibitors of cyclic electron transport. (C) 2013 The Authors. Published by Elsevier BM, on behalf of Federation of European Biochemical Societies. All rights reserved.

    DOI: 10.1016/j.fob.2013.09.007

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  • Substituent effects of cis-cinnamic acid analogues as plant growh inhibitors 査読

    Keisuke Nishikawa, Hiroshi Fukuda, Masato Abe, Kazunari Nakanishi, Tomoya Taniguchi, Takashi Nomura, Chihiro Yamaguchi, Syuntaro Hiradate, Yoshiharu Fujii, Katsuhiro Okuda, Mitsuru Shindo

    Phytochemistry   96   132 - 147   2013年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    1-O-cis-Cinnamoyl-β-d-glucopyranose is one of the most potent allelochemicals that has been isolated from Spiraea thunbergii Sieb by Hiradate et al. It derives its strong inhibitory activity from cis-cinnamic acid (cis-CA), which is crucial for phytotoxicity. By preparing and assaying a series of cis-CA analogues, it was previously found that the key features of cis-CA for lettuce root growth inhibition are a phenyl ring, cis-configuration of the alkene moiety, and carboxylic acid. On the basis of a structure-activity relationship study, the substituent effects on the aromatic ring of cis-CA were examined by systematic synthesis and the lettuce root growth inhibition assay of a series of cis-CA analogues having substituents on the aromatic ring. While ortho- and para-substituted analogues exhibited low potency in most cases, meta-substitution was not critical for potency, and analogues having a hydrophobic and sterically small substituent were more likely to be potent. Finally, several cis-CA analogues were found to be more potent root growth inhibitors than cis-CA. © 2013 Elsevier Ltd. All rights reserved.

    DOI: 10.1016/j.phytochem.2013.08.013

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  • Key structural features of cis-cinnamic acid as an allelochemical 査読

    Masato Abe, Keisuke Nishikawa, Hiroshi Fukuda, Kazunari Nakanishi, Yuta Tazawa, Tomoya Taniguchi, So-young Park, Syuntaro Hiradate, Yoshiharu Fujii, Katsuhiro Okuda, Mitsuru Shindo

    PHYTOCHEMISTRY   84   56 - 67   2012年12月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:PERGAMON-ELSEVIER SCIENCE LTD  

    1-O-cis-cinnamoyl-beta-D-glucopyranose is one of the most potent allelochemicals isolated from Spiraea thunbergii Sieb. It is suggested that it derives its strong inhibitory activity from cis-cinnamic acid, which is crucial for phytotoxicity. It was synthesized to confirm its structure and bioactivity, and also a series of cis-cinnamic acid analogues were prepared to elucidate the key features of cis-cinnamic acid for lettuce root growth inhibition. The cis-cyclopropyl analogue showed potent inhibitory activity while the saturated and alkyne analogues proved to be inactive, demonstrating the importance of the as-double bond. Moreover, the aromatic ring could not be replaced with a saturated ring. However, the 1,3-dienylcyclo-hexene analogue showed strong activity. These results suggest that the geometry of the C-C double bond between the carboxyl group and the aromatic ring is essential for potent inhibitory activity. In addition, using several light sources, the photostability of the cinnamic acid derivatives and the role of the C-C double bond were also investigated. (c) 2012 Elsevier Ltd. All rights reserved.

    DOI: 10.1016/j.phytochem.2012.08.001

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  • Molecular Design, Synthesis, and Evaluation of Novel Potent Apoptosis Inhibitors Inspired from Bongkrekic Acid 査読

    Katsuhiro Okuda, Keisuke Hasui, Masato Abe, Kenji Matsumoto, Mitsuru Shindo

    CHEMICAL RESEARCH IN TOXICOLOGY   25 ( 10 )   2253 - 2260   2012年10月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:AMER CHEMICAL SOC  

    Bongkrekic acid (BKA) is an inhibitor of adenine nucleotide translocase (ANT). Since inhibition of ANT is connected to the inhibition of cytochrome c release from mitochondria, which then results in the suppression of apoptosis, it has been used as a tool for the mechanistic investigation of apoptosis. BKA consists of a long carbon chain with two asymmetric centers, a nonconjugated olefin, two conjugated dienes, three methyl groups, a methoxyl group, and three carboxylic acids. This complicated chemical structure has caused difficulties in synthesis, supply, and biochemical mechanistic investigations. In this study, we designed and synthesized more simple tricarboxylic acids that were inspired by the molecular structure of BKA. Their cytotoxicity and apoptosis-preventing activity in HeLa cells and the effect on the mitochondrial inner membrane potential (Delta Psi m) in HL-60 cells were then evaluated. All tested tricarboxylic acid derivatives including BKA showed little toxicity against HeLa cells. BKA and two of the synthesized derivatives significantly suppressed staurosporine (STS)-induced reductions in cell viability. Furthermore, STS-induced Delta Psi m collapse was significantly restored by pretreatment with BKA and a tricarboxylic acid derivative. Other derivatives, in which one of three carboxylic acids was esterified, exhibited potent toxicity, especially a derivative bearing a carbon chain of the same length as that of BKA. In conclusion, we have developed a new lead compound as an apoptosis inhibitor bearing three carboxylic acids connected with the proper length of a long carbon chain.

    DOI: 10.1021/tx300315h

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  • Molecular Mechanisms for the Induction of Peroxidase Activity of the Cytochrome c-Cardiolipin Complex 査読

    Masato Abe, Ryota Niibayashi, Shinya Koubori, Ikuko Moriyama, Hideto Miyoshi

    BIOCHEMISTRY   50 ( 39 )   8383 - 8391   2011年10月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:AMER CHEMICAL SOC  

    Induction of the peroxidase activity of cytochrome c (cyt c) by cardiolipin (CL) and H(2)O(2) in mitochondria is suggested to be a key event in early apoptosis. Although electrostatic interaction between the positively charged cyt c and negatively charged CL is a predominant force behind the formation of a specific cyt c-CL complex and sequential induction of the peroxidase activity, molecular mechanisms of hydrophobic interactions involving the fatty acyl chains of CL remain to be investigated. To elucidate the function of the acyl chains, particularly the role of the double bond, we synthesized a variety of CL analogues and examined their peroxidase inducing activity. Irrespective of the number of double bonds in I the acyl chains, the peroxidase activity of cyt c induced by liposomes composed of 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphatidylcholine (DOPC) and a different CL (9:1 molar ratio) was similar, except for that of 1,1',2,2'-tetrastearoylcardiolipin (TSCL, C18:0)-containing liposomes. The peroxidase inducing activity of TSCL-containing liposomes was 3-4-fold greater than that of other CL-containing liposomes. The, peroxidase activity induced by all CL-containing liposomes was much lower at high ionic strengths than that at low ionic strengths because of diminution of the electrostatic interaction. The peroxidase inducing effects of various CL-containing liposomes were related well to their ability to associate with cyt c. Thus, our results revealed that at low CL levels, the saturated acyl chain of CL is favorable for the activation of peroxidase activity of CL-bound cyt c and the proposed critical role of the, double bond is not a general feature of the cyt c-CL interaction. The polarity of the membrane surface of TSCL-containing liposomes was slightly, but significantly, lower than that of other CL-containing liposomes, suggesting that the higher activating ability of TSCL-containing liposomes may be due to a reduced level of hydration of the polar head region reflecting tighter packing of the fully saturated acyl chains. Moreover, using CL analogues in which a central glycerol head moiety was modified, we revealed that the natural structure of the head moiety is not critical for the formation of the active cyt c-CL complex. The effects of the CL content of the liposomal membrane on the cyt c-CL interaction are discussed.

    DOI: 10.1021/bi2010202

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  • Bis-THF motif of acetogenin binds to the third matrix-side loop of ND1 subunit in mitochondrial NADH-ubiquinone oxidoreductase 査読

    Sayo Nakanishi, Masato Abe, Shuhei Yamamoto, Masatoshi Murai, Hideto Miyoshi

    BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-BIOENERGETICS   1807 ( 9 )   1170 - 1176   2011年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:ELSEVIER SCIENCE BV  

    Natural acetogenins are among the most potent inhibitors of bovine heart mitochondrial NADH-ubiquinone oxidoreductase (complex I). Our photoaffinity labeling study suggested that the hydroxylated bis-THF ring moiety of acetogenins binds at "site A" in the third matrix-side loop connecting the fifth and sixth transmembrane helices in the ND1 subunit [Kakutani et al. (2010) Biochemistry 49, 4794-4803]. Nevertheless, since this proposition was led using a photoreactive Delta lac-acetogenin derivative, it needs to be directly verified using a natural acetogenin-type probe. We therefore conducted photoaffinity labeling using a photoreactive natural acetogenin mimic ([(125)I]diazinylated natural acetogenin, [1251]DANA), which has a small photolabile diazirine group, in place of a hydroxy group, attached to the bis-THF ring moiety. Analysis of the photocross-linked protein in bovine heart submitochondrial particles unambiguously revealed that [(125)I]DANA binds to the membrane subunit ND1 with high specificity. The photocross-linking was completely blocked in the presence of just a 5-fold excess of bullatacin, indicating that [(125)I]DANA is an excellent mimic of natural acetogenins and hence binds to the site that accommodates natural products. Careful examination of the fragmentation patterns of the crosslinked ND1 generated by different proteases and their combinations indicated that the cross-linked residue is predominantly located at the supposed site A in the third matrix-side loop. (C) 2011 Elsevier B.V. All rights reserved.

    DOI: 10.1016/j.bbabio.2011.05.012

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  • Bis-THF motif of acetogenin binds to the third matrix-side loop of ND1 subunit in mitochondrial NADH-ubiquinone oxidoreductase 査読

    S. Nakanishi, M. Abe, S. Yamamoto, M. Murai, H. Miyoshi

    Biochimica et Biophysica Acta - Bioenergetics   1807 ( 9 )   1170 - 1176   2011年9月

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  • P-42 新規植物生長調整剤の開発を指向したシス桂皮酸の構造活性相関研究(ポスター発表の部)

    西川 慶祐, 安部 真人, 中西 一成, 谷口 智哉, 田澤 優太, 松尾 和真, 福田 洋, 朴 昭英, 平舘 俊太郎, 藤井 義晴, 新藤 充

    天然有機化合物討論会 天然有機化合物討論会講演要旨集   ( 53 )   607 - 612   2011年9月

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    記述言語:英語   出版者・発行元:天然有機化合物討論会  

    l -0-cis-Cinnamoyl-β-D-glucopyranose, an allelochemical isolated from Spiraea thunbergii, exhibits potent plant growth inhibitory activity. cis-Cinnamic acid is the essential portion structure of 1-0-cis-cinnamoyl-β-D-glucopyranose responsible for the growth inhibitory activity. cis-Cinnamic acid exhibited potent inhibitory activity against the elongation of lettuce roots, and the half maximal effective concentration (EC_<50>) of cis-cinnamic acid was 2.2 μM. In this project we adopted cis-cinnamic acid as a novel lead compound, and examined the structure-activity relationship of cis-cinnamic acid to develop the environmentally friendly agrochemical. Moreover, we synthesized the fluorescent probes of cis-cinnamic acid aiming at the clarification of the mechanism of the activity expression. At first, we synthesized 1-0-cis-cinnamoyl-β-D-glucopyranose by the Hanessian protocol, and the synthetic compound showed similar inhibitory activity (EC_<50> 6.4 μg/mL) with that of the natural product (EC_<50> 4.0 μg/rnL). Next, we synthesized the cis-cinnamic acid analogues, and evaluated the inhibitory activities on the elongation of lettuce roots. Some analogues were found to be more p

    DOI: 10.24496/tennenyuki.53.0_607

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  • Synthesis and characterization of photoaffinity probe of acetogenin, a strong inhibitor of mitochondrial complex I 査読

    Shuhei Yamamoto, Masato Abe, Sayo Nakanishi, Masatoshi Murai, Hideto Miyoshi

    TETRAHEDRON LETTERS   52 ( 24 )   3090 - 3093   2011年6月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:PERGAMON-ELSEVIER SCIENCE LTD  

    Acetogenins are valuable inhibitor probes to get an insight into the structural and functional properties of mitochondrial NADH-ubiquinone oxidoreductase (complex I). We synthesized a photoreactive acetogenin mimic ([(125)I]DANA) which retained a strong inhibitory activity. The preliminary photoaffinity labeling with bovine heart submitochondrial particles revealed that [(125)I]DANA binds to the ND1 subunit among 45 different subunits with high specificity. (C) 2011 Elsevier Ltd. All rights reserved.

    DOI: 10.1016/j.tetlet.2011.03.149

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  • Concise procedure for the synthesis of cardiolipins having different fatty acid combinations 査読

    Masato Abe, Shigeki Kitsuda, Shunji Ohyama, Shinya Koubori, Masatoshi Murai, Hideto Miyoshi

    TETRAHEDRON LETTERS   51 ( 15 )   2071 - 2073   2010年4月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:PERGAMON-ELSEVIER SCIENCE LTD  

    Production of a wide variety of cardiolipin (CL) analogues is critical for studying molecular mechanism of diverse biological functions of CL in mitochondria. We describe a concise procedure for the synthesis of CL using a phosphoramidite approach, which allows for the production of diverse CL analogues bearing linoleic acid(s) at any position on the glycerol backbone. (C) 2010 Elsevier Ltd. All rights reserved.

    DOI: 10.1016/j.tetlet.2010.02.071

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  • Synthesis of pyranicin and its deoxygenated analogues and their inhibitory action with bovine heart mitochondrial complex I 査読

    Shin-ichi Furuhata, Yasunao Hattori, Motonori Okajima, Hiroyuki Konno, Masato Abe, Hideto Miyoshi, Tetsuhisa Goto, Hidefumi Makabe

    TETRAHEDRON   64 ( 33 )   7695 - 7703   2008年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:PERGAMON-ELSEVIER SCIENCE LTD  

    Total synthesis of pyranicin and its deoxygenated analogues was achieved using Cl(2)Pd(CH(3)CN)(2) catalyzed diastereoselective cyclization of the allylic ester as the key step. The inhibitory activity of these compounds for mitochondrial NADH-ubiquinone oxicloreductase (complex I) was poorer than those of ordinary mono-THF acetogenins such as annonacin. (C) 2008 Elsevier Ltd. All rights reserved.

    DOI: 10.1016/j.tet.2008.06.028

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  • Dynamic function of the spacer region of acetogenins in the inhibition of bovine mitochondrial NADH-ubiquinone oxidoreductase (complex I) 査読

    Masato Abe, Akina Kubo, Shuhei Yamamoto, Yoshinori Hatoh, Masatoshi Murai, Yasunao Hattori, Hidefumi Makabe, Takaaki Nishioka, Hideto Miyoshi

    BIOCHEMISTRY   47 ( 23 )   6260 - 6266   2008年6月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:AMER CHEMICAL SOC  

    Studies of the action mechanism of acetogenins, the most potent and structurally unique inhibitors of bovine heart mitochondrial complex I (NADH-ubiquinone oxidoreductase), are valuable in characterizing the inhibitor binding site in this enzyme. Our previous study deepened our understanding of the dynamic function of the spacer region of bis-THF acetogenins [Abe, M., et al. (2005) Biochemistry 44, 14898-14906] but, at the same time, posed new important questions. First, while the two toxophores (i.e., the hydroxylated THF and the gamma-lactone rings) span a distance shorter than that of the extended 13 carbon atoms [-(CH(2))(13)-], what is the apparent optimal length of the spacer for the inhibition of 13 carbon atoms? In other words, what is the functional role of the additional methylene groups? Second, why was the inhibitory potency of the mono-THF derivative, but not the bis-THF derivative, drastically reduced by hardening the spacer covering 10 carbon atoms into a rodlike shape [-CH(2)-(C C)(4)-CH(2)-]? This study was designed not only to answer these questions but also to further disclose the dynamic functions of the spacer. We here synthesized systematically designed acetogenins, including mono- and bis-THF derivatives, and evaluated their inhibitory effects on bovine complex I. With regard to the first question, we demonstrated that the additional methylenes enhance the hydrophobicity of the spacer region, which may be thermodynamically advantageous for bringing the polar gamma-lactone ring into the membrane-embedded segment of complex I. With regard to the second question, we observed that a decrease in the flexibility of the spacer region is more adverse to the action of the mono-THF series than that of the bis-THF series. As a cause of this difference, we suggest that for bis-THF derivatives, one of the two THF rings, being adjacent to the spacer, is capable of working as a pseudospacer to overcome the remarkable decrease in the conformational freedom and/or the length of the spacer. Moreover, using photoresponsive acetogenins that undergo drastic and reversible conformational changes with alternating UV-vis irradiation, we provided further evidence that the spacer region is free from steric congestion arising from the putative binding site probably because there is no receptor wall for the spacer region.

    DOI: 10.1021/bi800506s

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  • Synthesis of pyranicin and its inhibitory action with bovine heart mitochondrial complex I 査読

    Yasunao Hattori, Shin-ichi Furuhata, Motonori Okajima, Hiroyuki Konno, Masato Abe, Hideto Miyoshi, Tetsuhisa Goto, Hidefumi Makabe

    ORGANIC LETTERS   10 ( 5 )   717 - 720   2008年3月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:AMER CHEMICAL SOC  

    Total synthesis of pyranicin was achieved using Cl(2)Pd(CH(3)CN)(2)-catalyzed diastereoselective cyclization of the allylic ester as the key step. The inhibitory activity of this compound for mitochondrial NADH-ubiquinone oxidoreductase (complex I) was slightly poorer than that of ordinary mono-THF acetogenins such as cis-solamin.

    DOI: 10.1021/ol70902w

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  • Crucial structural factors and mode of action of polyene Amides as inhibitors for mitochondrial NADH-Ubiquinone oxidoreductase (Complex I) 査読

    Takehiko Yoshida, Masatoshi Murai, Masato Abe, Naoya Ichimaru, Toshiyuki Harada, Takaaki Nishioka, Hideto Miyoshi

    BIOCHEMISTRY   46 ( 36 )   10365 - 10372   2007年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:AMER CHEMICAL SOC  

    Natural antibiotic polyene amides such as myxalamides are potent inhibitors of mitochondrial complex I. Because of the significant instability of this series of compounds due to an extended pi-conjugation skeleton, a detailed characterization of their inhibitory action has not been performed. To elucidate the action mechanism as well as binding manner of polyene an-tides with complex 1, identification of the roles of each functional group in the inhibitory action is needed. We here synthesized a series of amide analogues and carried out structure-activity studies with bovine heart mitochondrial complex I. With respect to the left-hand portion, the natural pi-conjugation skeleton common to many natural products is not required for the inhibition and can be substituted with a simpler substructure such as a conjugated diene. The geometry and shape of the left-hand portion were shown to be important for the inhibition, suggesting that this portion may bind to a narrow hydrophobic pocket in the enzyme rather than merely partitioning into the lipid membrane phase. Concerning the right-hand portion of the inhibitor, the presence of the 2-methyl, amide NH, and (S)-1'-methyl groups was crucial for the activity, suggesting that both methyl groups neighboring the amide group finely adjust the hydrogen-bonding ability of the amide group. in contrast, modifications of the 2'-OH group did not significantly influence the activity, suggesting that the role of this functional group is not to serve as a hydrogen bond donor to the enzyme but to act as a hydrophilic anchor directing the right-hand portion at or near the membrane surface. Detailed characterization of the action mechanism indicated that the polyene amides share a common binding domain with other complex I inhibitors, though their binding position (or manner) within the domain may differ considerably from that of other inhibitors.

    DOI: 10.1021/bi7010306

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  • Synthesis, determination of the absolute configuration of tonkinelin, and inhibitory action with bovine heart mitochondrial complex I 査読

    Yasunao Hattori, Hiroyuki Konno, Masato Abe, Hideto Miyoshi, Tetsuhisa Goto, Hidefumi Makabe

    BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY   15 ( 8 )   3026 - 3031   2007年4月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:PERGAMON-ELSEVIER SCIENCE LTD  

    The first synthesis of two possible diastereomers of tonkinelin was achieved. By comparison of the optical rotation of two candidates of tonkinelin and the natural compound, it is suggested that the absolute configuration of natural tonkinelin is likely to be (17S,18S). The inhibitory activity of these compounds was examined with bovine heart mitochondrial NADH-ubiquinone oxidoreductase. These compounds showed remarkably weak inhibitory activity compared to ordinary acetogenins such as bullatacin. (c) 2007 Elsevier Ltd. All rights reserved.

    DOI: 10.1016/j.bmc.2007.02.002

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  • Synthesis of murisolin, (15R, 16R, 19R, 20S)-murisolin A, and (15R, 16R, 19S, 20S)-16,19-cis-murisolin and their inhibitory action with bovine heart mitochondrial complex I 査読

    Yasunao Hattori, Yuka Kimura, Aki Moroda, Hiroyuki Konno, Masato Abe, Hideto Miyoshi, Tetsuhisa Goto, Hidefumi Makabe

    CHEMISTRY-AN ASIAN JOURNAL   1 ( 6 )   894 - 904   2006年12月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:WILEY-V C H VERLAG GMBH  

    The asymmetric total synthesis of murisolin, (15R, 16R, 19R, 20S)-murisolin A, and (15R, 16R, 19S, 20S)-16,19-cis-murisolin was performed by using an epoxy alcohol as a versatile chiral building block for synthesizing the stereoisomers of mono-THF annonaceous acetogenins. The inhibitory activity of these murisolin compounds was examined with bovine heart mitochondrial complex I, and they showed almost the same activity.

    DOI: 10.1002/asia.200600261

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  • Mode of inhibitory action of Δlac-acetogenins, a new class of inhibitors of bovine heart mitochondrial complex I 査読

    M. Murai, N. Ichimaru, M. Abe, T. Nishioka, H. Miyoshi

    Biochemistry   45 ( 32 )   9778 - 9787   2006年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/bi060713f

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  • Function of the alkyl side chains of Δlac-acetogenins in the inhibitory effect on mitochondrial complex I (NADH-ubiquinone oxidoreductase) 査読

    N. Ichimaru, M. Abe, M. Murai, M. Senoh, T. Nishioka, H. Miyoshi

    Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters   16 ( 13 )   3555 - 3558   2006年7月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bmcl.2006.03.082

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  • Synthesis of photolabile Δlac-acetogenin for photoaffinity labeling of mitochondrial complex I 査読

    M. Murai, N. Ichimaru, M. Abe, T. Nishioka, H. Miyoshi

    Journal of Pesticide Science   31 ( 2 )   156 - 158   2006年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1584/jpestics.31.156

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  • Dynamic function of the alkyl spacer of acetogenins in their inhibitory action with mitochondrial complex I (NADH-ubiquinone oxidoreductase) 査読

    M Abe, M Murai, N Ichimaru, A Kenmochi, T Yoshida, A Kubo, Y Kimura, A Moroda, H Makabe, T Nishioka, H Miyoshi

    BIOCHEMISTRY   44 ( 45 )   14898 - 14906   2005年11月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:AMER CHEMICAL SOC  

    Studies on the inhibitory mechanism of acetogenins, the most potent inhibitors of mitochondrial functional complex I (NADH-ubiquinone oxidoreductase), are useful for elucidating the structural and features of the terminal electron transfer step of this enzyme. Previous studies of the structure-activity relationship revealed that except for the alkyl spacer linking the two toxophores (i.e., the hydroxylated THF and the gamma-lactone rings), none of the multiple functional groups of these inhibitors is essential for potent inhibition. To elucidate the function of the alkyl spacer, two sets of systematically selected analogues were synthesized. First, the length of the spacer was varied widely. Second, the local flexibility of the spacer was specifically reduced by introducing multiple bond(s) into different regions of the spacer. The optimal length of the spacer for inhibition was approximately 13 carbon atoms. The decrease in the strength of the inhibitory effect caused by elongating the spacer from 13 carbons was much more drastic than that caused by shortening. Local flexibility in a specific region of the spacer was not important for the inhibition. These observations indicate that the active conformation,of the spacer is not an extended form, and is not necessarily restricted to a certain rigid shape. Moreover, an analogue in which a spacer covering 10 carbon atoms was hardened into a rodlike shape still maintained a potent inhibitory effect. Our results strongly suggest that the spacer portion is free from steric congestion arising from the putative binding site probably because there is no cavity-like binding site for the spacer portion. The manner of acetogenin binding to the enzyme may not be explained by a simple "key and keyhole" analogy.

    DOI: 10.1021/bi051568t

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  • Synthesis of non-THF analogs of acetogenin toward simplified mimics 査読

    D Fujita, N Ichimaru, M Abe, M Murai, T Hamada, T Nishioka, H Miyoshi

    TETRAHEDRON LETTERS   46 ( 34 )   5775 - 5779   2005年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:PERGAMON-ELSEVIER SCIENCE LTD  

    Acetogenin analogs in which the bis-adjacent THF ring was replaced with an enantioselectively synthesized 1,2-cyclo-pentanediol bis-ether skeleton were synthesized to obtain simplified mimics, and their inhibitory effect on mitochondrial NADH-ubiquinone oxidoreductase (complex I) was examined. The results clearly demonstrate that the 1,2-cyclopentanediol bis-ether motif can substitute for the bis-THF ring while maintaining very potent inhibitory activity at the nanomolar level. (c) 2005 Elsevier Ltd. All rights reserved.

    DOI: 10.1016/j.tetlet.2005.05.150

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  • Synthesis and inhibition mechanism of Δlac-acetogenins, a novel type of inhibitor of bovine heart mitochondrial complex I 査読

    N. Ichimaru, M. Murai, M. Abe, T. Hamada, Y. Yamada, S. Makino, T. Nishioka, H. Makabe, A. Makino, T. Kobayashi, H. Miyoshi

    Biochemistry   44 ( 2 )   816 - 825   2005年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/bi0479003

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  • Total synthesis of cis-solamin and its inhibitory action with bovine heart mitochondrial complex I 査読

    H Makabe, Y Hattori, Y Kimura, H Konno, M Abe, H Miyoshi, A Tanaka, T Oritani

    TETRAHEDRON   60 ( 47 )   10651 - 10657   2004年11月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:PERGAMON-ELSEVIER SCIENCE LTD  

    A convergent total synthesis of cis-solamin (1a) and its diastereomer (1b) was accomplished. A key reaction of this approach was the use of VO(acac)(2)-catalyzed diastereoselective epoxidation of (Z)-bis-homoallylic alcohol 3 followed by spontaneous cyclization for the cis-THF ring formation. By comparison of the optical rotation of the two possible diastereomers, it is suggested that the absolute configuration of natural cis-solamin is 1a. Inhibitory action of synthetic 1a and 1b with bovine heart mitochondrial complex I are reported. (C) 2004 Elsevier Ltd. All rights reserved.

    DOI: 10.1016/j.tet.2004.09.011

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  • Direct evidence for the interaction of stigmatellin with a protonated acidic group in the bc(1) complex from Saccharomyces cerevisiae as monitored by FTIR difference spectroscopy and C-13 specific labeling 査読

    M Ritter, H Palsdottir, M Abe, W Mantele, C Hunte, H Miyoshi, P Hellwig

    BIOCHEMISTRY   43 ( 26 )   8439 - 8446   2004年7月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:AMER CHEMICAL SOC  

    In this study a combined electrochemical and FTIR spectroscopic approach was applied to monitor the binding of stigmatellin, a Q(o) site inhibitor of the cytochrome bc(1) complex from Saccharomyces cerevisiae. Natural stigmatellin A induced clear shifts in the redox-induced FTIR difference spectra. For data interpretation a stigmatellin derivative (UST) with the conjugated trienes replaced by an aliphatic tail was synthesized, and the carbonyl group shown in crystal structures to interact with His181, the [2Fe-2S] ligand of the Rieske, was specifically C-13 labeled. Electrochemically induced FTIR difference spectra of the inhibitors in CH3OD were obtained and revealed signals characteristic for the oxidized and reduced forms of the labeled and unlabeled compounds. On the basis of signals from the inhibitors alone, the binding of the inhibitor to the bc(1) complex was monitored. Direct evidence for the interaction of the carbonyl group with the protein was provided by the observed shift of the v(C=O) vibrational mode of about 10 cm(-1). In addition, redox-dependent reorganizations of the protein were identified, including protonation changes of acidic residues at 1746 and 1734 cm(-1). The conformational changes observed upon inhibitor binding are discussed with respect to the crystal structures and proposed mechanistic models [Hunte, C., Koepke, J., Lange, C., Rossmanith, T., and Michel, H. (2000) Structure 8, 669-684; Palsdottir, H., Lojero, C. G., Trumpower, B. L., and Hunte, C. (2003) J. Biol. Chem. 278, 31303-31311].

    DOI: 10.1021/bi049649x

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  • Synthesis and inhibitory action of novel acetogenin mimics with bovine heart mitochondrial complex I 査読

    T Hamada, N Ichimaru, M Abe, D Fujita, A Kenmochi, T Nishioka, K Zwicker, U Brandt, H Miyoshi

    BIOCHEMISTRY   43 ( 12 )   3651 - 3658   2004年3月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:AMER CHEMICAL SOC  

    Studies on the inhibition mechanism of acetogenins, the most potent inhibitors of complex I, are useful to elucidate the structural and functional features of the terminal electron-transfer step of this enzyme. We synthesized acetogenin mimics that possess two alkyl tails without a gamma-lactone ring, named Deltalac-acetogenin, and examined their inhibitory action on bovine heart mitochondrial complex I. Unexpectedly, the Deltalac-acetogenin carrying two n-undecanyl groups (compound 3) elicited very potent inhibition comparable to that of bullatacin. The inhibitory potency of compound 3 markedly decreased with shortening the length of either or both alkyl tails, indicating that symmetric as well as hydrophobic properties of the inhibitor are important for the inhibition. Both acetylation and deoxygenation of either or both of two OH groups adjacent to the tetrahydrofuran (THF) rings resulted in a significant decrease in inhibitory potency. These structural dependencies of the inhibitory action of Deltalac-acetogenins are in marked contrast to those of ordinary acetogenins. Double-inhibitor titration of steady-state complex I activity showed that inhibition of compound 3 and bullatacin are not additive, though the inhibition site of both inhibitors is downstream of iron-sulfur cluster N2. Our results indicate that the mode of inhibitory action of Deltalac-acetogenins differs from that of ordinary acetogenins. Therefore, Deltalac-acetogenins can be regarded as a novel type of inhibitor acting on the terminal electron-transfer step of complex I.

    DOI: 10.1021/bi030242m

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  • Essential structural features of acetogenins: role of hydroxy groups adjacent to the bis-THF rings 査読

    M Abe, A Kenmochi, N Ichimaru, T Hamada, T Nishioka, H Miyoshi

    BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY LETTERS   14 ( 3 )   779 - 782   2004年2月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:PERGAMON-ELSEVIER SCIENCE LTD  

    The presence of two hydroxy groups adjacent to the THF ring(s) is a common structural feature of natural acetogenins. To elucidate the role of each hydroxy group in the inhibitory action of acetogenins, we synthesized three acetogenin analogues which lack either or both of the hydroxy groups, and investigated their inhibitory activities with bovine heart mitochondrial complex I. Our results indicate that the presence of either of the two hydroxy groups sufficiently sustains a potent inhibitory effect. (C) 2003 Elsevier Ltd. All rights reserved.

    DOI: 10.1016/j.bmcl.2003.11.021

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  • Synthesis and mitochondrial complex I inhibition of dihydroxy-cohibin A, non-THF annonaceous acetogenin analogue 査読

    H Konno, N Hiura, H Makabe, M Abe, H Miyoshi

    BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY LETTERS   14 ( 3 )   629 - 632   2004年2月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:PERGAMON-ELSEVIER SCIENCE LTD  

    To elucidate the inhibitory action of acetogenins, we synthesized an acetogenin derivative which possesses tetraol in place of the tetrahydrofuran ring and examined its inhibitory activity against bovine heart mitochondrial complex I. Our results indicate that these hydroxy groups are an essential structural factor though it is not effective as bis-THF hydroxy groups combination. (C) 2003 Elsevier Ltd. All rights reserved.

    DOI: 10.1016/j.bmcl.2003.11.057

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  • Synthesis and mitochondrial complex I inhibition of dihydroxy-cohibin A, non-THF annonaceous acetogenin analogue. 査読

    Konno H, Hiura N, Makabe H, Abe M, Miyoshi H

    Bioorganic & medicinal chemistry letters   14 ( 3 )   629 - 632   2004年2月

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  • Synthesis of two possible diastereomers of reticulatain-1 査読

    H Makabe, A Miyawaki, R Takahashi, Y Hattori, H Konno, M Abe, H Miyoshi

    TETRAHEDRON LETTERS   45 ( 5 )   973 - 977   2004年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:PERGAMON-ELSEVIER SCIENCE LTD  

    A convergent synthesis of two possible diastereomers of reticulatain-1 (1a and 1b) was accomplished. Comparison of the specific optical rotations of 1a and 1b did not allow for the strict determination of the absolute configuration. However, bis-(R)MTPA esters of la and lb showed a clear difference in chemical shifts in the (1) H NMR spectra. If the bis-(R)-MTPA ester of natural reticulatain-1 (1) is available, the absolute configuration of 1 will be determined. Inhibitory action of these compounds was examined with bovine heart mitochondrial complex I. Both compounds showed almost the same activity. (C) 2003 Elsevier Ltd. All rights reserved.

    DOI: 10.1016/j.tetlet.2003.11.109

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  • Synthesis of C-13-labeled ubiquinone-acetogenin hybrid inhibitors of mitochondrial complex I 査読

    N Ichimaru, M Abe, A Kenmochi, T Hamada, T Nishioka, H Miyoshi

    JOURNAL OF PESTICIDE SCIENCE   29 ( 2 )   127 - 129   2004年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:PESTICIDE SCI SOC JAPAN  

    Natural acetogenins are the most potent inhibitors of mitochondrial complex I. By synthesizing a ubiquinone-acetogenin hybrid inhibitor (named Q-acetogenin), we previously showed that a gamma-lactone ring of acetogenins is completely substitutable with a ubiquinone ring. In this study, to open a new experimental approach to the study of acetogenin-complex I interaction, we report procedures for synthesizing (13)G-labeled Q-acetogenins, wherein the carbonyl carbon at the 1- or 4-position of the ubiquinone ring is specifically C-13-labeled.

    DOI: 10.1584/jpestics.29.127

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  • Synthesis and inhibitory activity of ubiquinone-acetogenin hybrid inhibitor with bovine mitochondrial complex I 査読

    H Yabunaka, M Abe, A Kenmochi, T Hamada, T Nishioka, H Miyoshi

    BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY LETTERS   13 ( 14 )   2385 - 2388   2003年7月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:PERGAMON-ELSEVIER SCIENCE LTD  

    To elucidate the inhibitory action of acetogenins, the most potent inhibitors of mitochondrial complex I, we synthesized an acetogenin analogue which possesses a ubiquinone ring (i.e., the physiological substrate of complex I) in place of the alpha,beta-unsaturated gamma-lactone ring of natural acetogenins, and named it Q-acetogenin. Our results indicate that the gamma-lactone ring of acetogenins is completely substitutable with the ubiquinone ring. This fact is discussed in light of the inhibitory action of acetogenins. (C) 2003 Elsevier Science Ltd. All rights reserved.

    DOI: 10.1016/S0960-894X(03)00439-6

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MISC

  • 生理活性脂質を目指したMixed Acetalの合成研究

    田中遼太郎, 石橋洋平, 伊東信, 安部真人

    日本農芸化学会大会講演要旨集(Web)   2020   2020年

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  • 多価不飽和脂肪酸を有するホスファチジルセリンの合成研究

    多田大輝, 三澤嘉久, 馬場直道, 安部真人

    日本農芸化学会大会講演要旨集(Web)   2020   2020年

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  • リン脂質の化学合成を基盤とした生理機能解析の展開

    安部真人

    日本農芸化学会大会講演要旨集(Web)   2020   2020年

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  • 新規8R-リポキシゲナーゼ同定とプロテクチンD1酵素合成への応用

    結城彩花, 植村亜衣子, 箱崎真友佳, 矢野明, 馬場直道, 三澤嘉久, 安部真人, 山田秀俊

    日本農芸化学会大会講演要旨集(Web)   2020   2020年

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  • シス桂皮酸の植物生長調節作用-植物の方向認識を阻害する研究-

    安部真人

    日本農薬学会誌   45 ( 1 )   2020年

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  • エーテル型リン脂質プラズマローゲン類の合成

    安部真人, 田中遼太郎

    日本農芸化学会大会講演要旨集(Web)   2019   2019年

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  • 脂質分子が繋ぐ生命と環境

    安部真人

    農薬環境科学研究   ( 27 )   2019年

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  • 合成リゾカルジオリピン類縁体のトランスアシラーゼtafazzinに対する阻害効果

    安部真人, 千ヶ崎修平, 奥公秀, 阪井康能, 三芳秀人

    脂質生化学研究   61   2019年

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  • ミトコンドリア膜リン脂質カルジオリピンのリモデリング機構

    安部真人, 澤田良樹, 奥公秀, 阪井康能, 三芳秀人

    脂質生化学研究   60   84   2018年5月

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    記述言語:日本語  

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  • 酵母tafazzinによるカルジオリピンのリモデリング反応の基質特異性

    安部真人, 澤田良樹, 宇野晋平, 千ヶ崎修平, 奥公秀, 阪井康能, 三芳秀人

    日本農芸化学会大会講演要旨集(Web)   2018   ROMBUNNO.3A14a08 (WEB ONLY)   2018年3月

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    記述言語:日本語  

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  • ミトコンドリア膜表在性リモデリング酵素タファジンにおけるエーテル型PCの基質認識

    安部真人, 千ヶ崎修平, 奥公秀, 阪井能義, 三芳秀人

    日本農芸化学会中四国支部講演会講演要旨集(Web)   52nd   2018年

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  • 光反応性ホスファチジルコリンを用いた脂質抱合型apoA-Iの標識手法の確立

    藤本和希, 木村泰久, 安部真人, 三芳秀人, 植田和光, 植田和光

    日本農芸化学会大会講演要旨集(Web)   2018   2018年

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  • リン脂質ホスファチジルコリンの脱メチル化類縁体の合成研究

    安部真人, 辻諄人, 三芳秀人

    日本農芸化学会中四国支部講演会講演要旨集(Web)   51st   2018年

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  • カルジオリピン含有リポソームを用いた酵母由来tafazzinの基質特異性の解明

    安部真人, 長谷川結以, 奥公秀, 澤田良樹, 田中絵里子, 阪井康能, 三芳秀人

    生体膜と薬物の相互作用シンポジウム講演要旨集   38th   110‐111   2016年11月

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    記述言語:日本語  

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  • Saccharomyces cerevisiae由来tafazzinによるカルジオリピンのトランスアシル化反応の基質特異性

    安部真人, 長谷川結以, 奥公秀, 澤田良樹, 田中絵里子, 阪井康能, 三芳秀人

    日本生化学会大会(Web)   89th   ROMBUNNO.1T18‐01(1P‐374) (WEB ONLY) - 01(1P   2016年9月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(公社)日本生化学会  

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  • 出芽酵母tafazzinによるカルジオリピンのリモデリング機構に関する研究

    長谷川裕以, 安部真人, 奥公秀, 阪井康能, 三芳秀人

    日本農芸化学会大会講演要旨集(Web)   2016   2B077 (WEB ONLY)   2016年3月

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    記述言語:日本語  

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  • リン脂質カルジオリピンのシトクロムcに対する結合部位の同定

    安部真人, 田邊有貴恵, 三芳秀人

    日本農芸化学会大会講演要旨集(Web)   2015   2D12A06 (WEB ONLY)   2015年3月

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    記述言語:日本語  

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  • リン脂質カルジオリピンのシトクロムcへの結合部位の同定

    小坂亜弓, 田邊有貴恵, 安部真人, 三芳秀人

    日本農薬学会大会講演要旨集   39th   95   2014年3月

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    記述言語:日本語  

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  • リン脂質カルジオリピンのシトクロムcに対する結合部位の同定

    小坂亜弓, 田邊有貴恵, 安部真人, 三芳秀人

    日本農芸化学会大会講演要旨集(Web)   2014   3A05P05 (WEB ONLY)   2014年3月

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    記述言語:日本語  

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  • C35位を改変したバンレイシ科アセトゲニン誘導体のヒトがん細胞増殖抑制活性

    平田翔也, 小島直人, 里見純一朗, 嘉納将文, 大槻一文, 田中徹明, 矢守隆夫, 安部真人, 三芳秀人, 岩崎宏樹, 山下正行

    日本薬学会年会要旨集(CD-ROM)   134th   ROMBUNNO.29AMS-094S   2014年

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    記述言語:日本語  

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  • ボンクレキン酸に基づいた新規アポトーシス阻害剤の合成

    藤田聡, 松本健司, 陶山正樹, 森脇拓也, 福永幸裕, 奥田勝博, 安部真人, 狩野有宏, 新藤充

    日本薬学会九州支部大会講演要旨集   31st   2014年

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  • ボンクレキン酸誘導体の合成

    藤田聡, 松本健司, 陶山正樹, 森脇拓也, 福永幸裕, 奥田勝博, 安部真人, 狩野有宏, 新藤充

    有機合成化学セミナー講演予稿集   31st   2014年

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  • ボンクレキン酸を起点とするアポトーシス阻害剤の設計と活性評価

    松本健司, 陶山正樹, 森脇拓也, 蓮井啓佑, 福永幸裕, 奥田勝博, 安部真人, 狩野有宏, 新藤充

    天然有機化合物討論会講演要旨集(Web)   55th   2013年

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  • C35‐フッ素化solaminの合成とミトコンドリア複合体I阻害活性

    嘉納将文, 小島直人, 須賀友規, 大槻一文, 田中徹明, 安部真人, 三芳秀人, 岩崎宏樹, 山下正行

    日本薬学会年会要旨集(CD-ROM)   133rd   ROMBUNNO.28AMA-033S   2013年

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    記述言語:日本語  

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  • B312 光反応性アセトゲニンの合成と作用機構研究(作用機構,抵抗性 天然物化学,一般講演要旨)

    安部 真人, 中西 佐予, 山本 修平, 三芳 秀人

    講演要旨集   ( 37 )   127 - 127   2012年3月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:日本農薬学会  

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  • ミトコンドリア複合体‐Iにおけるアセトゲニン結合部位の同定

    中西佐予, 安部真人, 村井正俊, 三芳秀人

    日本農芸化学会大会講演要旨集(Web)   2012   3A05P14 (WEB ONLY)   2012年3月

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    記述言語:日本語  

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  • ミトコンドリア複合体‐Iにおけるアセトゲニンの結合部位の同定

    中西佐予, 安部真人, 山本修平, 村井正俊, 三芳秀人

    日本農芸化学会大会講演要旨集   2011   189   2011年3月

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    記述言語:日本語  

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  • 光親和性ユビキノンプローブの合成と標的タンパク質の解析

    土生沙綾子, 横山実, 村井正俊, 安部真人, 三芳秀人

    日本農芸化学会大会講演要旨集   2011   177   2011年3月

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    記述言語:日本語  

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  • ミトコンドリア複合体‐Iに作用する光反応性フェンピロキシメートの結合部位の同定

    村井正俊, 崎山直人, 白石悠祐, 安部真人, 三芳秀人

    日本農芸化学会大会講演要旨集   2011   189   2011年3月

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    記述言語:日本語  

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  • カルジオリピン類の合成によるシトクロムcとの分子間相互作用の解析

    新林良太, 幸掘伸哉, 森山郁子, 安部真人, 村井正俊, 三芳秀人

    日本農芸化学会大会講演要旨集   2011   177   2011年3月

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    記述言語:日本語  

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  • ミトコンドリア複合体‐Iに作用する光反応性フェンピロキシメートの結合部位の同定(II)

    崎山直人, 村井正俊, 白石悠祐, 安部真人, 三芳秀人

    日本農薬学会大会講演要旨集   36th   92   2011年2月

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    記述言語:日本語  

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  • 光反応性アセトゲニンの合成と作用機構研究

    安部真人, 中西佐予, 山本修平, 村井正俊, 三芳秀人

    日本農薬学会大会講演要旨集   36th   93   2011年2月

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    記述言語:日本語  

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  • ミトコンドリア複合体‐Iに作用する光反応性フェンピロキシメートの結合部位の同定(I)

    村井正俊, 崎山直人, 白石悠祐, 安部真人, 三芳秀人

    日本農薬学会大会講演要旨集   36th   91   2011年2月

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    記述言語:日本語  

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  • チトクロームc‐カルジオリピン複合体のペルオキシダーゼ活性誘導のための分子機構

    安部真人, 新林良太, 幸掘伸哉, 森山郁子, 三芳秀人

    生化学   ROMBUNNO.2T8P-13   2011年

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    記述言語:日本語  

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  • 新規な光合成サイクリック電子伝達阻害剤の探索

    平純考, 桶川友季, 杉本和彦, 安部真人, 三芳秀人, 鹿内利治

    日本植物生理学会年会要旨集   52nd   187   2011年

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  • 機能性ユビキノンプローブの合成とユビキノン結合性タンパク質の探索

    横山実, 土生紗綾子, 村井正俊, 安部真人, 三芳秀人

    日本農芸化学会関西支部講演会講演要旨集   468th   7   2011年

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    記述言語:日本語  

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  • 第16回 ヨーロッパ生体エネルギー会議(EBEC)に参加して(シンポジア)

    安部 真人

    Journal of pesticide science   35 ( 4 )   591 - 592   2010年11月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:日本農薬学会  

    DOI: 10.1584/jpestics.35.591

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  • 光反応性アセトゲニンの合成と作用機構研究

    中西佐予, 山本修平, 安部真人, 村井正俊, 三芳秀人

    日本農芸化学会関西支部講演会講演要旨集   466th   53   2010年10月

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    記述言語:日本語  

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  • モノテトラヒドロフラン型バンレイシ科アセトゲニンの系統的な合成とテトラヒドロピラン環を有するアセトゲニンの合成研究

    真壁秀文, 服部恭尚, 大麻真由, 嶋本康広, 今野博行, 安部真人, 三芳秀人

    天然有機化合物討論会講演要旨集   52nd ( 52 )   421 - 426   2010年9月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:天然有機化合物討論会  

    1. Synthesis of mono-THF acetogenin The asymmetric synthesis of murisolin (1), (15R,16R,19R,20S)-murisolin A (2), (15R,16R,19S,20S)-16,19-cis-murisolin (3), solamin (4), cis-solamin (5), annonacin (6) was performed using an epoxy alcohol 11 as a versatile chiral building block for synthesizing the stereoisomers of mono-THF annonaceous acetogenins. 2. Synthetic studies of THP containing acetogenins Synthesis of pyranicin (7), 10-deoxypyranicin (8), 4,10-dideoxypyranicin (9) was achieved using Pd(II)-catalyzed diastereoselective cyclization of the allylic ester as the key step. Synthesis of THP moiety of mucocin (10) is currently underway. 3. The inhibitory activity of mitochondrial complex I The inhibitory activity of mitochondrial comlex I of mono-THF acetogenins showed almost same activities. This observation suggested that the stereochemistry around the THF ring(s) is of minor importance for the activity. As to the inhibitory activity of pyranicin (7) and its dehydrogenated analogues, the activity was poorer than that of ordinary mono-THF acetogenins.

    DOI: 10.24496/tennenyuki.52.0_421

    CiNii Books

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  • Synthesis of cardiolipin analogues bearing a biophysical probe at any position of the four acyl chains 査読

    Masato Abe, Shunya Koubori, Hideto Miyoshi

    BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-BIOENERGETICS   1797   19 - 19   2010年7月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究発表ペーパー・要旨(国際会議)   出版者・発行元:ELSEVIER SCIENCE BV  

    DOI: 10.1016/j.bbabio.2010.04.076

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  • 光反応性アセトゲニンの合成と作用機構研究

    安部真人, 山本修平, 村井正俊, 三芳秀人

    日本農薬学会大会講演要旨集   35th   45   2010年4月

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    記述言語:日本語  

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  • 広汎なカルジオリピン類の有機合成と生理活性評価

    安部真人, 大山俊治, 幸堀伸哉, 森山郁子, 村井正俊, 三芳秀人

    日本農芸化学会大会講演要旨集   2010   16   2010年3月

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    記述言語:日本語  

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  • ミトコンドリア複合体‐I阻害剤Δlac‐アセトゲニンの結合部位の解明

    村井正俊, 角谷信至, 崎山直人, 安部真人, 三芳秀人

    日本生体エネルギー研究会討論会講演要旨集   36th   134 - 135   2010年

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    記述言語:日本語  

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  • ANT阻害剤ボンクレキン酸の誘導体合成と構造活性相関

    松尾啓史, 安部真人, 狩野有宏, 丸山厚, 新藤充

    日本薬学会年会要旨集   129th ( 2 )   2009年

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  • ボンクレキン酸のアポトーシス阻害効果に関する構造活性相関研究

    安部真人, 佐藤幸子, 松尾啓史, 狩野有宏, 丸山厚, 新藤充

    日本農芸化学会大会講演要旨集   2009   2009年

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  • パラジウム触媒による環化反応を用いたpyranicinとspectamine Aの合成研究

    毛利圭宏, 服部恭尚, 古畑真一, 今野博行, 安部真人, 三芳秀人, 真壁秀文

    天然有機化合物討論会講演要旨集   50th   599 - 604   2008年9月

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    記述言語:日本語  

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  • ミトコンドリア複合体‐I阻害剤アセトゲニン類の作用機構研究 bis‐THF体とmono‐THF体の比較から

    安部真人, 山本修平, 真壁秀文, 西岡孝明, 三芳秀人

    日本農薬学会大会講演要旨集   33rd   39   2008年3月

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    記述言語:日本語  

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  • ミトコンドリア複合体‐I阻害剤アセトゲニン類のスペーサー部の機能

    安部真人, 山本修平, 西岡孝明, 真壁秀文, 三芳秀人

    日本農芸化学会大会講演要旨集   2008   170   2008年3月

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    記述言語:日本語  

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  • Pyranicinの合成とミトコンドリアcomplex Iの阻害活性

    古畑真一, 服部恭尚, 今野博行, 安部真人, 三芳秀人, 後藤哲久, 真壁秀文

    日本農芸化学会大会講演要旨集   2008   17   2008年3月

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    記述言語:日本語  

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  • ミトコンドリア複合体―I阻害剤アセトゲニン類のスペーサー部の機能

    安部真人, 羽藤義倫, 真壁秀文, 西岡孝明, 三芳秀人

    日本農芸化学会大会講演要旨集   2007   259   2007年3月

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    記述言語:日本語  

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  • Synthesis of (17S, 18S)- and (17R, 18R)-tonkinelin and their inhibitory action with bovine heart mitochondorial complex I.

    Hattori, Y, Konno, H, Abe, M, Miyoshi, H, Goto, T, Makabe, H

    Bioorg. Med. Chem.   15   3026 - 3031   2007年

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  • ミトコンドリア複合体-I阻害剤アセトゲニンの阻害機構研究 : スペーサー部の機能

    安部 真人, 久保 明奈, 西岡 孝明, 三芳 秀人

    講演要旨集   31   66 - 66   2006年3月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:日本農薬学会  

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  • 新規アセトゲニンmimics(Δlac‐アセトゲニン)の合成と作用機構研究

    一丸直哉, 村井正俊, 安部真人, 妹尾麻衣, 真壁秀文, 西岡孝明, 三芳秀人

    日本農芸化学会大会講演要旨集   2006   6   2006年3月

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    記述言語:日本語  

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  • ミトコンドリア複合体‐I阻害剤アセトゲニン類の阻害機構研究:スペーサー部の機能

    安部真人, 村井正俊, 一丸直哉, 吉田健彦, 久保明奈, 西岡孝明, 三芳秀人

    日本農芸化学会大会講演要旨集   2006   5   2006年3月

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    記述言語:日本語  

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  • Δ‐lacアセトゲニンの複合体‐Iに対する作用機構研究

    村井正俊, 一丸直哉, 安部真人, 西岡孝明, 三芳秀人

    日本農芸化学会大会講演要旨集   2006   6   2006年3月

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    記述言語:日本語  

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  • Δlac‐アセトゲニン類の合成と作用機構研究

    一丸直哉, 村井正俊, 安部真人, 浜田剛, 槙野早恵, 真壁秀文, 西岡孝明, 三芳秀人

    日本農芸化学会大会講演要旨集   2005   13   2005年3月

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    記述言語:日本語  

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  • ミトコンドリア複合体‐I阻害剤アセトゲニンの阻害機構研究:スペーサー部の機能

    安部真人, 村井正俊, 一丸直哉, 吉田健彦, 西岡孝明, 三芳秀人

    日本農芸化学会関西支部講演会講演要旨集   2005   103   2005年

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    記述言語:日本語  

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  • 新規アセトゲニンmimics(Δlac‐アセトゲニン)の合成と作用機構研究

    一丸直哉, 村井正俊, 安部真人, 浜田剛, 槙野早恵, 真壁秀文, 西岡孝明, 三芳秀人

    日本農芸化学会関西支部講演会講演要旨集   2005   104   2005年

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    記述言語:日本語  

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  • モノテトラヒドロフラン型アセトゲニンアナログの合成とミトコンドリア活性

    今野博行, 藤井信孝, 真壁秀文, 木村由香, 三芳秀人, 安倍真人

    反応と合成の進歩シンポジウム講演要旨集   30th   238 - 239   2004年9月

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  • Synthesis and inhibitory action of novel acetogenin mimics with bovine mitochondrial complex I

    H Miyoshi, T Hamada, N Ichimaru, M Abe, D Fujita, A Kenmochi, T Nishioka, K Zwicker, U Brandt

    BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-BIOENERGETICS   1658   138 - 138   2004年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究発表ペーパー・要旨(国際会議)   出版者・発行元:ELSEVIER SCIENCE BV  

    Web of Science

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  • <sup>13</sup>C標識stigmatellinの合成とFTIR分光法によるミトコンドリア複合体‐IIIの動態研究

    三芳秀人, 安部真人, HELLWING P

    日本農芸化学会大会講演要旨集   2003   269   2003年3月

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    記述言語:日本語  

    J-GLOBAL

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講演・口頭発表等

  • ANT阻害剤ボンクレキン酸の誘導体合成と構造活性相関

    安部真人

    日本薬学会第129年会  2009年 

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    記述言語:日本語  

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  • ボンクレキン酸のアポトーシス阻害効果に関する構造活性相関研究

    安部真人

    日本農芸化学会2009年度大会  2009年 

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    記述言語:日本語  

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  • cis-桂皮酸の構造活性相関研究(1) -オレフィンと芳香環上の置換基の効果-

    安部真人

    日本農芸化学会2009年度大会  2009年 

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    記述言語:日本語  

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  • 光反応性アセトゲニンの合成と作用機構研究

    安部真人

    日本農芸化学会2010年度関西支部大会  2010年 

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    記述言語:日本語  

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  • カルジオリピンの合成に基づくシトクロムc‐カルジオリピン複合体形成の分子機構解明

    安部真人, 新林良太, 幸堀伸哉, 三芳秀人

    日本生体エネルギー研究会討論会講演要旨集  2010年 

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    記述言語:日本語  

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  • 広汎なカルジオリピン類の有機合成と生理活性評価

    安部真人

    日本農芸化学会2010年度大会  2010年 

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    記述言語:日本語  

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  • 細胞毒性を有するボンクレキン酸部分構造の構造活性相関

    安部真人

    第47回化学関連支部合同九州大会  2010年 

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    記述言語:日本語  

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  • 強いアレロパシー活性を示すシス桂皮酸の構造活性相関研究

    安部真人

    日本薬学会第131年会  2011年 

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    記述言語:日本語  

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  • 2A03 光反応性アセトゲニンの合成と作用機構研究(合成プロセス 分子設計,一般講演要旨)

    安部 真人, 山本 修平, 村井 正俊, 三芳 秀人

    講演要旨集  2010年4月 

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    記述言語:日本語  

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  • アポトーシスを制御する有機小分子

    安部真人

    第五回物質合成シンポジウム  2009年 

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    記述言語:日本語  

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  • ミトコンドリア複合体‐Ⅰにおけるアセトゲニン類の結合部位の同定

    安部真人

    日本農芸化学会2011年度大会(東日本大震災により中止)  2011年 

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    記述言語:日本語  

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  • カルジオリピン類の合成によるシトクロムcとの分子間相互作用の解析

    安部真人

    日本農芸化学会2011年度大会(東日本大震災により中止)  2011年 

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    記述言語:日本語  

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  • 光親和性ユビキノンプローブの合成と標的タンパク質の解析

    安部真人

    日本農芸化学会2011年度大会(東日本大震災により中止)  2011年 

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    記述言語:日本語  

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  • ミトコンドリア複合体-Iに作用する光反応性フェンピロキシメートの結合部位の同定(I)

    安部真人

    日本農薬学会第36回大会(東日本大震災)により中止  2011年 

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    記述言語:日本語  

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  • 光反応性アセトゲニンの合成と作用機構研究

    安部真人

    日本農薬学会第36回大会(東日本大震災)により中止  2011年 

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    記述言語:日本語  

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  • B312 光反応性アセトゲニンの合成と作用機構研究(作用機構,抵抗性 天然物化学,一般講演要旨)

    安部 真人, 中西 佐予, 山本 修平, 三芳 秀人

    講演要旨集  2012年3月 

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    記述言語:日本語  

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  • A301 ミトコンドリア複合体-Iに作用する光反応性フェンピロキシメートの結合部位の同定(I)(作用機構・抵抗性,一般講演要旨)

    村井 正俊, 崎山 直人, 白石 悠祐, 安部 真人, 三芳 秀人

    講演要旨集  2011年2月 

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    記述言語:日本語  

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  • アポトーシス阻害剤ボンクレキン酸および誘導体の収束型効率合成

    安部真人

    有機合成化学協会 第20回若手のためのセミナー  2008年 

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    記述言語:日本語  

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  • A208 ミトコンドリア複合体-I阻害剤アセトゲニン類の作用機構研究 : bis-THF体とmono-THF体の比較から

    安部真人

    講演要旨集  2008年3月 

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    記述言語:日本語  

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  • ミトコンドリア複合体-I 阻害剤アセトゲニン類のスペーサー部の機能

    安部真人

    日本農芸化学会2008年度大会  2008年 

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    記述言語:日本語  

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  • ボンクレキン酸の抗アポトーシス作用と細胞毒性

    安部真人

    日本ケミカルバイオロジー学会第4回年会  2009年 

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    記述言語:日本語  

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  • ボンクレキン酸及び誘導体の効率合成とアポトーシス阻害活性

    安部真人

    日本化学会第89春季年会  2009年 

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    記述言語:日本語  

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共同研究・競争的資金等の研究課題

  • 善玉コレステロール形成反応の分子機構解明

    2022年4月 - 2026年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(B)

    木村 泰久, 安部 真人

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    配分額:17160000円 ( 直接経費:13200000円 、 間接経費:3960000円 )

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  • 過酸化リン脂質をケミカルプローブに用いる作用点タンパク質の網羅的解析

    2022年4月 - 2025年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

    安部 真人, 河崎 悠也

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    配分額:4290000円 ( 直接経費:3300000円 、 間接経費:990000円 )

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  • オキシリピン類の酵素カスケード合成法の開発に基づく抗炎症・抗血栓シーズの創出

    2022年 - 2024年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(A))

    安部 真人

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    配分額:15600000円 ( 直接経費:12000000円 、 間接経費:3600000円 )

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  • 脂質分子動態に基づく骨格筋再生機構の全容解明

    2021年10月 - 2024年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(B))

    原 雄二, 安部 真人, 神谷 厚輝, 北嶋 康雄, 鈴木 美希, 塩見 晃史

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    配分額:19110000円 ( 直接経費:14700000円 、 間接経費:4410000円 )

    骨格筋線維の再生過程において、筋幹細胞(筋衛星細胞)の分裂に端を発した筋芽細胞への運命決定や、筋芽細胞の細胞融合は必須な現象である。しかしこれらの各素過程、特に膜リン脂質分子群の挙動を制御し、筋幹細胞および融合体(筋管)の形成に至る機構は未だ明らかではない。これまでの研究(Nature Commun., 2018等)に端を発し、本申請では「脂質二重層間におけるリン脂質の非対称分布(リン脂質配向性)の変化が、最上流因子として細胞分裂・細胞融合、ひいては筋線維の再生を制御する」という作業仮説の実証・深化を目指す 。特にProf. Kobayashi(ストラスブール大学)との共同研究「超解像イメージング解析による筋再生過程での脂質分子の動態解析」を通じ、脂質分子動態を基軸とした骨格筋線維の再生機構の全容解明を目指す。筋再生機構は老化や各種疾患に伴う筋萎縮治療法の構築に直接つながることから、超高齢化社会を迎えた我が国において、本研究遂行による「筋恒常性維持を介した健康長寿の達成」は極めて重要であると言える。
    本研究におて、①細胞融合の起点となるリン脂質分子動態の検出・同定、②筋幹細胞(筋衛星細胞)でのリン脂質動態の役割解明、および③脂質配向性を基軸とした現象の、分子~生体レベルでの理解深化、という実験を行う。当該年度では、COVID-19等の影響もあり、海外への渡航は出来なかったこともあり、次年度以降の国際共同研究に向け、準備を進めている。

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  • リン脂質カルジオリピン過酸化物の精密合成に基づくシトクロムcの遊離機構の解明

    2019年4月 - 2022年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業 基盤研究(C)  基盤研究(C)

    安部 真人, 河崎 悠也

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    配分額:4420000円 ( 直接経費:3400000円 、 間接経費:1020000円 )

    平成31年度は、カルジオリピン過酸化物の全合成における重要中間体一級水酸基を保護したモノアシルグリセロールの効率的合成方法を確立した.すなわち、マンニトールからS体の,アスコルビン酸から,R体のソルケタールを合成した後,得られたソルケタールをモノアシルグリセロールへと誘導する経路である.これらの成果は,本研究の主目的の一つである「カルジオリピン過酸化物及びそれらの二次参加生成物の網羅的合成」の基盤技術となりうる.
    高度不飽和脂肪酸の過酸化反応による過酸化脂肪酸の合成にも着手した.まず,リノール酸の空気酸化による過酸化脂肪酸の合成を試みたが,望ましい収率で目的物を得ることはできなかった.そこで次に,ペルオキシダーゼを添加して過酸化反応を行う手法,基質をジアシルグリセロールやリン脂質に誘導してから過酸化反応を行う手法について検討した.その結果,副生成物が生じる問題はあるものの,一定の収率で目的とする過酸化脂質を得ることに成功した.しかし、過酸化脂質のヒドロペルオキシ基の分子内転位が徐々に進行することが明らかになった.この問題を回避するために,ヒドロペルオキシ基を2-methoxy propene (Mxp)基で保護した後に精製する手法を検討中である.
    研究分担者の河崎は,シリルアルケンの付加型オゾン酸化の反応機構解明に関する論文を発表した.この知見に基づき,過酸化脂肪酸の合成を検討している。

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  • 脂質の多様な機能を司るオルガネラ間相互作用と脂質輸送メカニズムの解明

    2018年4月 - 2020年3月

    日本学術振興会  科学研究費補助金 基盤研究(B) 

    和田 元

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    資金種別:競争的資金

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  • 変異体を用いた新規合成脂質スクリーニングが解き明かす光合成膜脂質の機能

    2017年6月 - 2021年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業 挑戦的研究(萌芽)  挑戦的研究(萌芽)

    小林 康一, 安部 真人

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    配分額:6370000円 ( 直接経費:4900000円 、 間接経費:1470000円 )

    生体膜を構成する極性脂質には数千を超える分子種が存在するが、生物がこれほどまでに多様な脂質分子を利用する意義は未だに不明である。本研究では、シアノバクテリアが外部から脂質分子を容易に取り込む性質を利用し、シアノバクテリア内で様々な機能や生理活性を発揮する脂質分子のケミカルスクリーニングを行うことで、これまで予想もされなかった脂質分子の新規機能の発見と解明を目指す。本研究では特に、光合成に必須の役割を担うホスファチジルグリセロール(PG)を解析する。
    研究は2つのグループにより行っている。安部グループはリン脂質全合成法を用いたPG類の人工合成を担い、小林グループは合成されたPGを用いたシアノバクテリア内での生理活性テストを担当する。これまで、安部グループによる化学合成の結果、PGの脂肪酸の炭素鎖長を改変し、二重結合の位置や数も様々に変更した分子種を得ることができた。また、PGと性質の近いカルジオリピンにおいても、多様な分子種を合成することに成功している。小林グループが進める研究では、安部グループにより合成されたPGアナログを用いた解析を進めた。その結果、PGの脂肪酸をすべて飽和脂肪酸にすると、シアノバクテリアのPG欠損変異体でクロロフィルの分解が急速に進むことを明らかにした。一方で、野生株には飽和脂肪酸PGは影響を与えなかったことから、細胞内でのPG合成が起こらないときに外部から脂肪酸構造の異なるPGが入ってくることで、クロロフィルの分解が引き起こされるようになることが明らかとなった。クロロフィル分解とPGとの関係を調べるため、窒素欠乏下でのシアノバクテリアの生育を調べたところ、予想に反して窒素欠乏下ではクロロフィルはほとんど分解しない一方、フィコビリソームの分解にはPGが強く影響することが明らかとなった。

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  • 変異体を用いた新規合成脂質スクリーニングが解き明かす光合成膜脂質の機能

    2017年6月 - 2020年3月

    日本学術振興会  科学研究費補助金 挑戦的研究(萌芽) 

    小林 康一

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    資金種別:競争的資金

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  • オルガネラの健常性を支えるオートファジー・脂質代謝の分子機構解明

    2016年4月 - 2019年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業 基盤研究(C)  基盤研究(C)

    奥 公秀, 安部 真人

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    配分額:4810000円 ( 直接経費:3700000円 、 間接経費:1110000円 )

    本研究課題では、オルガネラの健常性を維持するための分子機構を明らかにすることを主たる目的とした。特に、ミトコンドリア、脂肪滴の健常性(恒常性)維持の分子機構について、脂質代謝およびオートファジーに着目した解析を進めた。
    ミトコンドリア特有の脂質であるカルジオリピンの脂肪酸部分の組成を決定する要因として、タファジンと呼ばれる酵素が持つ基質特異性を明らかにした。オートファジー機能タンパク質であるAtg8が中性脂質分解(リポリシス)を抑制する働きをもつことを示した。さらに、ESCRTと呼ばれるタンパク質ファミリーに依存した、液胞膜の変形を伴うオートファジー(ミクロオートファジー)を見出した。

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  • リン脂質カルジオリピンの生合成リモデリング系の分子機構解明

    2014年4月 - 2017年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業 基盤研究(C)  基盤研究(C)

    安部 真人, 奥 公秀

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    担当区分:研究代表者  資金種別:競争的資金

    配分額:5070000円 ( 直接経費:3900000円 、 間接経費:1170000円 )

    カルジオリピン(CL)は、ミトコンドリアに局在するリン脂質で種々の膜タンパク質や輸送担体の活性発現に必須である。CLの生合成では、リモデリング系によって脂肪酸部の選択性が得られるが、詳細は不明である。そこで本研究ではリモデリング系に関わるとされるトランスアシラーゼ、タファジンの基質特異性を明らかにすることを目的とした。このために、種々のCL、リゾCL、ホスファチジルコリンの有機合成を行い、構造活性相関研究を展開した。結果は、酵母由来タファジンにおいて飽和脂肪酸のトランスアシル化が優位に遅いこと、およびホスファチジルコリンのsn-2位を主なアシルドナーとして認識することを初めて明らかにした。

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  • シトクロムc‐カルジオリピン複合体の形成と解離に関する分子機構の化学的解明

    2012年4月 - 2014年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業 若手研究(B)  若手研究(B)

    安部 真人

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    担当区分:研究代表者  資金種別:競争的資金

    配分額:4680000円 ( 直接経費:3600000円 、 間接経費:1080000円 )

    カルジオリピン(CL)はミトコンドリア内膜に局在し、シトクロムc(cyt c)との複合体形成によりペルオキシダーゼ活性を誘導することがアポトーシス初動過程の鍵反応であると考えられている。本研究では、CL脂肪酸部に位置特異的に水酸基を導入することで、一連の酸化CLを合成した。これらを用いたペルオキシダーゼ誘導活性を評価した結果、どの酸化CLにおいても強いペルオキシダーゼ誘導活性を示すことがわかった。水酸基の位置や数による影響の違いはみられなかった。

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  • カルジオリピンの合成に基づくシトクロムc-カルジオリピン複合体形成の分子機構解明

    2010年 - 2011年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業 若手研究(B)  若手研究(B)

    安部 真人

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    配分額:3900000円 ( 直接経費:3000000円 、 間接経費:900000円 )

    カルジオリピン(CL)はミトコンドリア内膜に局在するリン脂質であり、チトクロムc(cyt c)との複合体形成によりアポトーシス初動過程に関与すると考えられている。本研究では、cyt c-CL複合体の形成に由来するペルオキシダーゼ活性に着目し、CL類縁体の系統的な化学合成を行い、それらの比較検討を行った。その結果、(1)従来重要とされてきた脂肪酸部の不飽和結合は必須ではない、(2)ペルオキシダーゼ誘導はCLのcyt cに対する親和性で決まる、ということを明らかにした。

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  • 機能性アセトゲニンの有機合成を基盤とする呼吸鎖酵素複合体-Iの研究

    2005年 - 2006年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業 特別研究員奨励費  特別研究員奨励費

    安部 真人

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    配分額:1800000円 ( 直接経費:1800000円 )

    アセトゲニン類の複合体-I阻害に要求される構造因子としてスペーサー部の機能に注目した類縁体合成を行った。スペーサー部にtetra-yne構造を導入した類縁体は、bis-THF環を持つ類縁体においては阻害活性の低下が見られなかったのに対してmono-THF環を持った類縁体においては顕著な活性の低下が見られた。この興味深い結果を更に深く掘り下げることでアセトゲニン類の阻害活性時におけるスペーサー部のコンフォメーションを検討した。
    tetra-yne構造の影響をより詳細に検討するためにtetra-yneに連なるメチレン鎖を改変した化合物を新規に合成した。Bis-THF環についてはメチレン鎖が2つ長いものと2つ短いものを合成した。Mono-THF環についてはスペーサー部全体の柔軟性の回復を期待してメチレン鎖が1つ長いものと2つ長いものを合成した。複合体-1阻害活性の評価の結果は、bis-THF環についてはIC50にして数nMレベルの強い活性を維持した。一方でmono-THF環についてはともにIC50で100nMを越え、期待したような阻害活性の回復は見られなかった。更にmono-THF環を持った類縁体についてスペーサーの長さは炭素数にして13個に固定した上で、同じ部位にそれぞれtri-yne、diyneと柔軟性を回復させた類縁体を合成した。結果はそれぞれ78nM、11nMと阻害活性の回復が認められた。このことからmono-THF環を持った類縁体に導入した多重結合は、THF環に近い位置に存在する立体障害として働いていることが強く示唆された。
    以上の結果は2007年3月の日本農芸化学会大会で口頭発表を行った。
    今後は更にスペーサー部の構造改変からスペーサー部の機能のみならずTHF環の働きについても考察できるような類縁体合成を行い、それらの結果を以って論文発表を行う予定である。

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